REMARK SPARTA+ Protein Chemical Shift Prediction Table REMARK REMARK All chemical shifts are reported in ppm: REMARK REMARK SS_SHIFT is the predicted secondary chemical shift. REMARK SHIFT is the predicted chemical shift. REMARK RC_SHIFT is the random coil chemical shift. REMARK HM_SHIFT is the ring current shift; a correction REMARK of 0.6 times this value is applied. REMARK EF_SHIFT is the adjustment for electric field effect, REMARK applied to proton shifts only. REMARK SIGMA is the estimated prediction error. REMARK REMARK Reference: REMARK Y. Shen and A. Bax: SPARTA+: a modest improvement in empirical NMR REMARK chemical shift prediction by means of an artificial neural network. REMARK J. Biomol. NMR 48, 13-22 (2010). DATA SOURCE 1vqo_1_F DATA FIRST_RESID 1 DATA SEQUENCE PVYVDFDVPA DLEDDALEAL EVARDTGAVK KGTNETTKSI ERGSAELVFV DATA SEQUENCE AEDVQPEEIV MHIPELADEK GVPFIFVEQQ DDLGHAAGLE VGSAAAAVTD DATA SEQUENCE AGEADADVED IADKVEELR VARS RESID RESNAME ATOMNAME SS_SHIFT SHIFT RC_SHIFT HM_SHIFT EF_SHIFT SIGMA FORMAT %4d %4s %4s %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f 1 P HA 0.000 nan 4.420 nan 0.000 0.216 1 P C 0.000 177.030 177.300 -0.450 0.000 1.155 1 P CA 0.000 62.739 63.100 -0.601 0.000 0.800 1 P CB 0.000 31.501 31.700 -0.332 0.000 0.726 2 V N -0.422 119.310 119.914 -0.303 0.000 2.809 2 V HA -0.095 4.025 4.120 0.000 0.000 0.256 2 V C 1.931 177.990 176.094 -0.058 0.000 1.080 2 V CA 1.851 64.082 62.300 -0.115 0.000 1.102 2 V CB -1.309 30.510 31.823 -0.006 0.000 0.705 2 V HN 0.480 nan 8.190 nan 0.000 0.475 3 Y N -0.353 119.884 120.300 -0.104 0.000 2.458 3 Y HA 0.683 5.233 4.550 0.000 0.000 0.256 3 Y C 0.597 176.418 175.900 -0.132 0.000 1.159 3 Y CA -0.914 57.139 58.100 -0.078 0.000 1.261 3 Y CB -0.673 37.751 38.460 -0.060 0.000 1.119 3 Y HN 0.030 nan 8.280 nan 0.000 0.524 4 V N 2.956 122.512 119.914 -0.596 0.000 2.383 4 V HA 0.157 4.277 4.120 0.000 0.000 0.275 4 V C -0.227 175.668 176.094 -0.333 0.000 1.036 4 V CA -0.454 61.364 62.300 -0.804 0.000 0.889 4 V CB 1.272 32.413 31.823 -1.136 0.000 0.985 4 V HN 0.293 nan 8.190 nan 0.000 0.459 5 D N 4.364 124.691 120.400 -0.121 0.000 2.440 5 D HA 0.257 4.897 4.640 0.000 0.000 0.216 5 D C -0.407 176.012 176.300 0.200 0.000 1.150 5 D CA 0.503 54.542 54.000 0.065 0.000 0.832 5 D CB 0.800 41.733 40.800 0.223 0.000 0.992 5 D HN 0.537 nan 8.370 nan 0.000 0.502 6 F N -0.799 119.247 119.950 0.161 0.000 2.704 6 F HA 0.356 4.883 4.527 -0.000 0.000 0.312 6 F C -1.624 174.261 175.800 0.142 0.000 1.108 6 F CA -1.525 56.553 58.000 0.130 0.000 1.005 6 F CB 0.765 39.845 39.000 0.132 0.000 1.277 6 F HN -0.386 nan 8.300 nan 0.000 0.445 7 D N 2.080 122.664 120.400 0.307 0.000 2.232 7 D HA 0.517 5.157 4.640 0.000 0.000 0.242 7 D C -1.052 175.432 176.300 0.307 0.000 1.093 7 D CA -0.252 53.874 54.000 0.210 0.000 0.845 7 D CB 1.980 42.837 40.800 0.095 0.000 1.124 7 D HN 0.565 nan 8.370 nan 0.000 0.467 8 V N 6.149 126.245 119.914 0.303 0.000 2.406 8 V HA 0.311 4.431 4.120 0.000 0.000 0.272 8 V C -1.838 174.343 176.094 0.144 0.000 1.043 8 V CA -1.549 60.904 62.300 0.255 0.000 0.915 8 V CB 1.091 33.086 31.823 0.288 0.000 0.988 8 V HN 0.631 nan 8.190 nan 0.000 0.466 9 P HA 0.053 nan 4.420 nan 0.000 0.264 9 P C 0.817 178.157 177.300 0.066 0.000 1.183 9 P CA 0.230 63.371 63.100 0.068 0.000 0.763 9 P CB 0.758 32.486 31.700 0.046 0.000 0.807 10 A N 3.815 126.670 122.820 0.058 0.000 1.971 10 A HA -0.277 4.043 4.320 0.000 0.000 0.222 10 A C 1.767 179.384 177.584 0.055 0.000 1.182 10 A CA 2.079 54.150 52.037 0.057 0.000 0.649 10 A CB -0.996 18.030 19.000 0.044 0.000 0.818 10 A HN 0.554 nan 8.150 nan 0.000 0.458 11 D N -0.382 120.045 120.400 0.045 0.000 2.084 11 D HA -0.113 4.527 4.640 0.000 0.000 0.196 11 D C 2.015 178.340 176.300 0.042 0.000 0.985 11 D CA 1.146 55.169 54.000 0.039 0.000 0.826 11 D CB -0.447 40.370 40.800 0.028 0.000 0.978 11 D HN 0.451 nan 8.370 nan 0.000 0.456 12 L N 1.167 122.414 121.223 0.039 0.000 2.043 12 L HA -0.221 4.119 4.340 0.000 0.000 0.212 12 L C 2.503 179.405 176.870 0.053 0.000 1.075 12 L CA 1.498 56.358 54.840 0.033 0.000 0.752 12 L CB -0.172 41.901 42.059 0.023 0.000 0.891 12 L HN 0.040 nan 8.230 nan 0.000 0.432 13 E N -0.338 119.907 120.200 0.076 0.000 2.110 13 E HA -0.265 4.085 4.350 0.000 0.000 0.193 13 E C 1.685 178.354 176.600 0.114 0.000 0.988 13 E CA 1.477 57.941 56.400 0.107 0.000 0.804 13 E CB 0.014 29.785 29.700 0.118 0.000 0.745 13 E HN 0.518 nan 8.360 nan 0.000 0.458 14 D N 0.883 121.335 120.400 0.087 0.000 2.104 14 D HA -0.177 4.463 4.640 0.000 0.000 0.194 14 D C 1.568 177.917 176.300 0.083 0.000 0.994 14 D CA 1.319 55.367 54.000 0.080 0.000 0.830 14 D CB -0.200 40.636 40.800 0.058 0.000 0.959 14 D HN 0.312 nan 8.370 nan 0.000 0.452 15 D N 0.854 121.297 120.400 0.072 0.000 2.097 15 D HA -0.115 4.525 4.640 0.000 0.000 0.195 15 D C 2.089 178.452 176.300 0.104 0.000 0.989 15 D CA 1.023 55.063 54.000 0.068 0.000 0.827 15 D CB -0.260 40.566 40.800 0.045 0.000 0.966 15 D HN 0.110 nan 8.370 nan 0.000 0.456 16 A N 1.414 124.315 122.820 0.134 0.000 1.873 16 A HA -0.177 4.143 4.320 0.000 0.000 0.218 16 A C 2.474 180.291 177.584 0.388 0.000 1.193 16 A CA 1.189 53.376 52.037 0.249 0.000 0.629 16 A CB -0.988 18.124 19.000 0.187 0.000 0.826 16 A HN 0.197 nan 8.150 nan 0.000 0.447 17 L N -0.792 120.604 121.223 0.289 0.000 2.042 17 L HA -0.243 4.097 4.340 0.000 0.000 0.210 17 L C 2.638 179.547 176.870 0.065 0.000 1.076 17 L CA 1.817 56.747 54.840 0.150 0.000 0.749 17 L CB -0.740 41.389 42.059 0.116 0.000 0.893 17 L HN 0.514 nan 8.230 nan 0.000 0.432 18 E N 0.241 120.488 120.200 0.079 0.000 2.077 18 E HA -0.218 4.132 4.350 0.000 0.000 0.193 18 E C 2.326 178.951 176.600 0.042 0.000 0.989 18 E CA 1.176 57.603 56.400 0.045 0.000 0.800 18 E CB -0.211 29.517 29.700 0.047 0.000 0.746 18 E HN 0.506 nan 8.360 nan 0.000 0.452 19 A N 1.252 124.122 122.820 0.083 0.000 1.972 19 A HA -0.167 4.153 4.320 0.000 0.000 0.219 19 A C 2.154 179.777 177.584 0.066 0.000 1.169 19 A CA 1.040 53.130 52.037 0.087 0.000 0.635 19 A CB -0.412 18.669 19.000 0.134 0.000 0.810 19 A HN 0.222 nan 8.150 nan 0.000 0.446 20 L N 0.017 121.263 121.223 0.037 0.000 2.072 20 L HA -0.063 4.277 4.340 0.000 0.000 0.205 20 L C 2.067 178.870 176.870 -0.112 0.000 1.079 20 L CA 2.193 56.959 54.840 -0.124 0.000 0.752 20 L CB -0.780 40.998 42.059 -0.468 0.000 0.906 20 L HN 0.504 nan 8.230 nan 0.000 0.436 21 E N -0.446 119.703 120.200 -0.085 0.000 2.031 21 E HA -0.206 4.144 4.350 0.000 0.000 0.193 21 E C 2.150 178.716 176.600 -0.055 0.000 0.994 21 E CA 1.973 58.323 56.400 -0.083 0.000 0.800 21 E CB -0.368 29.291 29.700 -0.069 0.000 0.752 21 E HN 0.559 nan 8.360 nan 0.000 0.447 22 V N -1.104 118.793 119.914 -0.029 0.000 2.759 22 V HA -0.052 4.068 4.120 0.000 0.000 0.256 22 V C 2.164 178.249 176.094 -0.016 0.000 1.080 22 V CA 1.414 63.704 62.300 -0.017 0.000 1.101 22 V CB -0.630 31.192 31.823 -0.002 0.000 0.698 22 V HN 0.195 nan 8.190 nan 0.000 0.477 23 A N 2.555 125.364 122.820 -0.018 0.000 1.873 23 A HA -0.169 4.151 4.320 0.000 0.000 0.215 23 A C 2.425 179.993 177.584 -0.026 0.000 1.186 23 A CA 2.012 54.042 52.037 -0.013 0.000 0.616 23 A CB -0.497 18.498 19.000 -0.008 0.000 0.823 23 A HN 0.760 nan 8.150 nan 0.000 0.442 24 R N -0.183 120.289 120.500 -0.047 0.000 2.090 24 R HA -0.044 4.296 4.340 0.000 0.000 0.228 24 R C 1.133 177.411 176.300 -0.036 0.000 1.110 24 R CA 1.508 57.579 56.100 -0.048 0.000 0.973 24 R CB -0.634 29.625 30.300 -0.069 0.000 0.869 24 R HN 0.358 nan 8.270 nan 0.000 0.440 25 D N 0.327 120.706 120.400 -0.035 0.000 2.149 25 D HA -0.061 4.579 4.640 0.000 0.000 0.201 25 D C 1.183 177.472 176.300 -0.018 0.000 0.972 25 D CA 1.610 55.594 54.000 -0.027 0.000 0.835 25 D CB 0.021 40.805 40.800 -0.027 0.000 0.966 25 D HN 0.306 nan 8.370 nan 0.000 0.476 26 T N 0.017 114.562 114.554 -0.014 0.000 3.608 26 T HA 0.252 4.602 4.350 0.000 0.000 0.213 26 T C 1.327 176.023 174.700 -0.006 0.000 0.897 26 T CA 0.505 62.600 62.100 -0.008 0.000 1.533 26 T CB -0.662 68.204 68.868 -0.004 0.000 1.504 26 T HN 0.112 nan 8.240 nan 0.000 0.446 27 G N 1.087 109.885 108.800 -0.003 0.000 2.467 27 G HA2 0.475 4.435 3.960 0.000 0.000 0.243 27 G HA3 0.475 4.435 3.960 0.000 0.000 0.243 27 G C -0.403 174.494 174.900 -0.004 0.000 1.521 27 G CA 0.133 45.233 45.100 0.000 0.000 1.055 27 G HN 0.758 nan 8.290 nan 0.000 0.553 28 A N -1.461 121.359 122.820 0.000 0.000 2.386 28 A HA 0.711 5.031 4.320 0.000 0.000 0.311 28 A C -0.563 177.020 177.584 -0.001 0.000 1.068 28 A CA -0.124 51.912 52.037 -0.003 0.000 0.743 28 A CB 1.794 20.795 19.000 0.001 0.000 1.258 28 A HN 1.937 nan 8.150 nan 0.000 0.429 29 V N -0.940 118.967 119.914 -0.012 0.000 3.049 29 V HA 0.780 4.900 4.120 0.000 0.000 0.309 29 V C -1.192 174.892 176.094 -0.017 0.000 1.148 29 V CA -1.210 61.080 62.300 -0.017 0.000 0.990 29 V CB 2.078 33.869 31.823 -0.053 0.000 1.039 29 V HN 0.712 nan 8.190 nan 0.000 0.430 30 K N 2.208 122.604 120.400 -0.008 0.000 2.164 30 K HA 0.623 4.943 4.320 0.000 0.000 0.258 30 K C -0.911 175.681 176.600 -0.014 0.000 0.951 30 K CA -0.472 55.812 56.287 -0.004 0.000 0.844 30 K CB 2.052 34.559 32.500 0.012 0.000 1.099 30 K HN 0.874 nan 8.250 nan 0.000 0.435 31 K N 0.530 120.922 120.400 -0.013 0.000 2.323 31 K HA 0.696 5.016 4.320 0.000 0.000 0.259 31 K C -0.197 176.403 176.600 -0.000 0.000 0.947 31 K CA -0.975 55.303 56.287 -0.015 0.000 0.819 31 K CB 1.799 34.286 32.500 -0.023 0.000 1.109 31 K HN 0.756 nan 8.250 nan 0.000 0.429 32 G N 1.033 109.837 108.800 0.007 0.000 2.742 32 G HA2 -0.176 3.784 3.960 0.000 0.000 0.686 32 G HA3 -0.176 3.784 3.960 0.000 0.000 0.686 32 G C 0.326 175.239 174.900 0.022 0.000 1.220 32 G CA -0.723 44.386 45.100 0.014 0.000 0.783 32 G HN 0.440 nan 8.290 nan 0.000 0.646 33 T N 1.096 115.666 114.554 0.028 0.000 2.833 33 T HA -0.155 4.195 4.350 0.000 0.000 0.269 33 T C 2.277 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0.438 67 A N -1.135 121.676 122.820 -0.016 0.000 1.898 67 A HA -0.110 4.210 4.320 0.000 0.000 0.214 67 A C 1.975 179.643 177.584 0.140 0.000 1.183 67 A CA 1.310 53.396 52.037 0.080 0.000 0.622 67 A CB -0.586 18.516 19.000 0.170 0.000 0.824 67 A HN 0.468 nan 8.150 nan 0.000 0.444 68 D N 0.651 121.154 120.400 0.172 0.000 2.149 68 D HA -0.152 4.488 4.640 0.000 0.000 0.198 68 D C 1.218 177.568 176.300 0.084 0.000 0.990 68 D CA 1.526 55.617 54.000 0.152 0.000 0.839 68 D CB -0.362 40.538 40.800 0.166 0.000 0.948 68 D HN 0.840 nan 8.370 nan 0.000 0.460 69 E N 0.320 120.559 120.200 0.065 0.000 2.296 69 E HA 0.057 4.407 4.350 0.000 0.000 0.196 69 E C 0.475 177.099 176.600 0.039 0.000 1.143 69 E CA 0.067 56.495 56.400 0.046 0.000 1.145 69 E CB 0.248 29.971 29.700 0.039 0.000 1.215 69 E HN -0.052 nan 8.360 nan 0.000 0.447 70 K N -0.567 119.860 120.400 0.045 0.000 2.614 70 K HA 0.112 4.432 4.320 0.000 0.000 0.198 70 K C 0.946 177.568 176.600 0.037 0.000 1.338 70 K CA 0.391 56.701 56.287 0.038 0.000 1.066 70 K CB 1.059 33.582 32.500 0.038 0.000 1.119 70 K HN 0.333 nan 8.250 nan 0.000 0.609 71 G N 1.669 110.493 108.800 0.040 0.000 2.249 71 G HA2 -0.318 3.642 3.960 0.000 0.000 0.269 71 G HA3 -0.318 3.642 3.960 0.000 0.000 0.269 71 G C 0.409 175.324 174.900 0.025 0.000 0.979 71 G CA 0.918 46.033 45.100 0.026 0.000 0.644 71 G HN 0.124 nan 8.290 nan 0.000 0.546 72 V N 2.453 122.396 119.914 0.048 0.000 2.485 72 V HA 0.304 4.424 4.120 0.000 0.000 0.287 72 V C -1.281 174.855 176.094 0.071 0.000 1.022 72 V CA -0.779 61.553 62.300 0.053 0.000 1.067 72 V CB 0.931 32.793 31.823 0.065 0.000 0.967 72 V HN 0.152 nan 8.190 nan 0.000 0.479 73 P HA 0.419 nan 4.420 nan 0.000 0.275 73 P C -0.890 176.384 177.300 -0.043 0.000 1.227 73 P CA -0.127 62.911 63.100 -0.104 0.000 0.781 73 P CB 0.504 32.120 31.700 -0.141 0.000 0.906 74 F N 1.524 121.384 119.950 -0.151 0.000 2.613 74 F HA 0.823 5.350 4.527 0.000 0.000 0.314 74 F C -1.324 174.302 175.800 -0.289 0.000 1.075 74 F CA -1.446 56.420 58.000 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nan 8.290 nan 0.000 0.490 93 S N -1.537 114.184 115.700 0.034 0.000 2.689 93 S HA 0.505 4.975 4.470 0.000 0.000 0.274 93 S C 0.776 175.403 174.600 0.046 0.000 1.176 93 S CA 0.322 58.539 58.200 0.030 0.000 1.014 93 S CB 1.234 64.444 63.200 0.016 0.000 1.071 93 S HN 1.254 nan 8.310 nan 0.000 0.478 94 A N 3.542 126.387 122.820 0.042 0.000 2.014 94 A HA 0.669 4.989 4.320 0.000 0.000 0.218 94 A C 1.039 178.660 177.584 0.061 0.000 1.163 94 A CA 1.095 53.163 52.037 0.051 0.000 0.652 94 A CB -0.298 18.720 19.000 0.029 0.000 0.808 94 A HN 1.511 nan 8.150 nan 0.000 0.449 95 A N -2.242 120.609 122.820 0.052 0.000 2.606 95 A HA 0.787 5.107 4.320 0.000 0.000 0.293 95 A C -0.619 177.003 177.584 0.064 0.000 1.082 95 A CA 0.032 52.109 52.037 0.067 0.000 0.685 95 A CB 0.801 19.812 19.000 0.019 0.000 1.284 95 A HN 1.649 nan 8.150 nan 0.000 0.408 96 A N -0.418 122.466 122.820 0.107 0.000 2.606 96 A HA 1.004 5.324 4.320 0.000 0.000 0.293 96 A C -0.642 177.036 177.584 0.155 0.000 1.082 96 A CA -0.007 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1.400 103 E HN 1.320 nan 8.360 nan 0.000 0.423 104 A N -0.868 121.960 122.820 0.014 0.000 2.733 104 A HA 0.081 4.401 4.320 0.000 0.000 0.232 104 A C 1.178 178.775 177.584 0.022 0.000 1.251 104 A CA 0.007 52.056 52.037 0.020 0.000 1.015 104 A CB 0.574 19.591 19.000 0.028 0.000 1.291 104 A HN 0.147 nan 8.150 nan 0.000 0.595 105 D N 1.275 121.685 120.400 0.016 0.000 2.149 105 D HA -0.216 4.424 4.640 0.000 0.000 0.194 105 D C 2.147 178.452 176.300 0.007 0.000 1.001 105 D CA 1.670 55.678 54.000 0.013 0.000 0.849 105 D CB -0.079 40.726 40.800 0.009 0.000 0.939 105 D HN 0.516 nan 8.370 nan 0.000 0.449 106 A N 1.795 124.619 122.820 0.005 0.000 1.851 106 A HA -0.213 4.107 4.320 0.000 0.000 0.216 106 A C 1.936 179.520 177.584 0.000 0.000 1.195 106 A CA 1.859 53.896 52.037 0.001 0.000 0.622 106 A CB -0.446 18.554 19.000 0.001 0.000 0.831 106 A HN 0.103 nan 8.150 nan 0.000 0.444 107 D N -0.177 120.228 120.400 0.007 0.000 2.084 107 D HA -0.116 4.524 4.640 0.000 0.000 0.194 107 D C 2.119 178.424 176.300 0.008 0.000 0.990 107 D CA 1.661 55.666 54.000 0.009 0.000 0.826 107 D CB -0.654 40.158 40.800 0.021 0.000 0.971 107 D HN 0.193 nan 8.370 nan 0.000 0.453 108 V N 1.455 121.381 119.914 0.020 0.000 2.380 108 V HA -0.271 3.849 4.120 0.000 0.000 0.251 108 V C 2.487 178.573 176.094 -0.013 0.000 1.063 108 V CA 1.968 64.280 62.300 0.020 0.000 1.055 108 V CB -0.538 31.310 31.823 0.041 0.000 0.657 108 V HN 0.244 nan 8.190 nan 0.000 0.455 109 E N -0.218 119.974 120.200 -0.013 0.000 2.072 109 E HA -0.231 4.119 4.350 0.000 0.000 0.191 109 E C 1.910 178.487 176.600 -0.039 0.000 0.985 109 E CA 1.454 57.838 56.400 -0.026 0.000 0.801 109 E CB -0.072 29.617 29.700 -0.018 0.000 0.750 109 E HN 0.643 nan 8.360 nan 0.000 0.452 110 D N 0.601 120.982 120.400 -0.032 0.000 2.097 110 D HA -0.154 4.486 4.640 0.000 0.000 0.197 110 D C 2.172 178.439 176.300 -0.055 0.000 0.984 110 D CA 1.088 55.065 54.000 -0.038 0.000 0.826 110 D CB -0.194 40.590 40.800 -0.025 0.000 0.973 110 D HN 0.322 nan 8.370 nan 0.000 0.460 111 I N 1.719 122.259 120.570 -0.052 0.000 2.151 111 I HA -0.308 3.862 4.170 0.000 0.000 0.243 111 I C 2.673 178.720 176.117 -0.116 0.000 1.080 111 I CA 1.240 62.496 61.300 -0.074 0.000 1.339 111 I CB -0.358 37.602 38.000 -0.067 0.000 1.039 111 I HN -0.077 nan 8.210 nan 0.000 0.409 112 A N 0.585 123.334 122.820 -0.118 0.000 1.883 112 A HA -0.255 4.065 4.320 0.000 0.000 0.217 112 A C 2.019 179.513 177.584 -0.150 0.000 1.186 112 A CA 2.147 54.095 52.037 -0.149 0.000 0.624 112 A CB -0.678 18.252 19.000 -0.117 0.000 0.822 112 A HN 0.405 nan 8.150 nan 0.000 0.444 113 D N -0.092 120.241 120.400 -0.111 0.000 2.092 113 D HA -0.159 4.481 4.640 0.000 0.000 0.193 113 D C 1.850 178.078 176.300 -0.121 0.000 0.994 113 D CA 1.611 55.549 54.000 -0.104 0.000 0.828 113 D CB -0.351 40.405 40.800 -0.074 0.000 0.963 113 D HN 0.500 nan 8.370 nan 0.000 0.450 114 K N 0.571 120.904 120.400 -0.111 0.000 2.211 114 K HA -0.096 4.224 4.320 0.000 0.000 0.204 114 K C 2.203 178.701 176.600 -0.169 0.000 1.047 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